Philippe GAMBETTE
Maître de conférences en informatique
Champs-sur-Marne
Bâtiment: Building: Copernic
5 boulevard Descartes$Champs-sur-Marne$77454 Marne-la-Vallée Cedex 2
Bureau: Office: 4B100
Philippe GAMBETTE
Maître de conférences en informatique
Maitre de conférences en informatique, j'effectue mes recherches en algorithmique pour les humanités numériques et pour la bioinformatique au LIGM, Laboratoire d'informatique Gaspard-Monge. Je m'intéresse en particulier à des problématiques d'analyses de réseaux en développant des algorithmes de graphes, et à des questions algorithmiques ou mathématiques d'alignement entre structures (textes, arbres, réseaux, etc.).
Je donne la plupart de mes enseignements au département MMI, Métiers du multimédia et de l'internet, à l'IUT de Marne-la-Vallée, sur le site de Champs-sur-Marne. J'y enseigne le développement web en Javascript et les bases de données. J'enseigne aussi le Javascript en master Culture et métiers du web et l'intégration HTML/CSS en master Édition du livre papier et numérique.
Je co-encadre avec Catherine Dominguès le doctorat de Chuanming Dong (ADEME, IGN) au LASTIG depuis octobre 2019. Je co-encadre avec Cyril Nicaud le doctorat d'Aaron Boussidan (Université Gustave Eiffel) au LIGM depuis septembre 2021.
Membre depuis février 2017 du conseil de la formation doctorale de la COMUE Paris-Est Sup, je suis aussi référent Égalité de Paris-Est Sup avec Bénédicte François. Chargé de mission « Science ouverte » pour la vice-présidence recherche de l'université Gustave Eiffel depuis mars 2021, je coordonne le réseau des ambassadeurs et ambassadrices DATA de l'atelier Data Univ. Eiffel.
Mes dernières références
My latest references
Publications
A Corpus of Critical Citations Contexts. Journal of Open Humanities Data, 2024, 10, pp.1-6
⟨10.5334/johd.215⟩
Le don par Marceline Desbordes-Valmore du portrait de son père au musée de la Chartreuse. J'écris pourtant, 2024, 5, pp.181-189
Detecting semantic or structural similarities for theater play comparison. JADT 2024, Jun 2024, Bruxelles (BE), Belgium. pp.139-148
Les lieux nommés d’après Marceline Desbordes-Valmore. J'écris pourtant, 2024, 5, pp.87-98
Berkemer, Pierre Bourhis, Philippe Gambette, Lionel Seinturier, Marion Tommasi. A Database Approach to Solve the Tree Containment Problem in Phylogenetic Networks. Mathematics of Evolution - Phylogenetic Trees and Networks. Workshop 1: Foundations of Phylogenetic Networks, Sep 2023, Singapour, Singapore. pp.5-8
On Distances between Words with Parameters. CPM 2023, Jun 2023, Champs-sur-Marne, Marne-la-Vallée, France. pp.6:1-6:23
⟨10.4230/LIPIcs.CPM.2023.6⟩
Ancien ou moderne ? Pistes computationnelles pour l'analyse graphématique des textes écrits au XVIIe siècle. Linx, 2023, 85
⟨10.4000/linx.9346⟩
Extraction et caractérisation de noyaux d’événements liés à la pollution industrielle. JADT 2022, Jul 2022, Naples, Italie. pp.354-360
Automatic Normalisation of Early Modern French. LREC 2022 - 13th Language Resources and Evaluation Conference, European Language Resources Association, Jun 2022, Marseille, France. pp.3354-3366
The Evolution of the Idiolect over the Lifetime: A Quantitative and Qualitative Study of French 19th Century Literature. Soirée networking PRAIRIE, Sep 2022, Paris, France. 2022
The Evolution of the Idiolect over the Lifetime: A Quantitative and Qualitative Study of French 19th Century Literature. Journal of Cultural Analytics, 2022, 7 (3)
⟨10.22148/001c.37588⟩
Édition numérique et valorisation du livre de compte de la reine Marguerite de Navarre rédigé par son secrétaire Jehan Frotté. Assemblée générale 2022 du programme de recherche « Bibliothèques Virtuelles Humanistes », Programme de recherche « Bibliothèques Virtuelles Humanistes », Nov 2022, Tours, France
Reordering a tree according to an order on its leaves. CPM 2022, Jun 2022, Prague, Czech Republic. pp.24:1-24:15
⟨10.4230/LIPIcs.CPM.2022.24⟩
Vers l’étude linguistique sur données artificielles. Variation(s) en français, ATILF, Nov 2022, Nancy, France
Le changement linguistique au XVIIe s. : nouvelles approches scriptométriques. CMLF 2022 - 8e Congrès Mondial de Linguistique Française, Jul 2022, Orléans, France. pp.02006.1-14
⟨10.1051/shsconf/202213802006⟩
Le projet FREEM : ressources, outils et enjeux pour l’étude du français d’Ancien Régime. TALN 2022 - Traitement Automatique des Langues Naturelles, Jun 2022, Avignon, France. pp.154-165
From FreEM to D'AlemBERT. 13th Language Resources and Evaluation Conference - LREC 2022, European Language Resources Association, Jun 2022, Marseille, France. pp.3367-3374
Identifier, représenter, penser les réseaux urbains de l’humanisme autour de Marguerite de Valois : l’exemple du voyage des Flandres (1577). Les femmes dans les réseaux urbains de l’humanisme (1492-1615), Jun 2022, Bordeaux, France
Expanding the content model of annotationBlock. Next Gen TEI, 2021 - TEI Conference and Members’ Meeting, Oct 2021, Virtual, United States
The Corpus for Idiolectal Research (CIDRE). Journal of Open Humanities Data, 2021, 7, pp.15
⟨10.5334/johd.42⟩
Valoriser des corpus littéraires numériques avec Wikisource : de la recherche à la pédagogie. Lionel Barbe; Marta Severo. Wikipédia. Objet de médiation et de transmission des savoirs, Presses universitaires de Paris Nanterre, pp.159-176, 2021, Intelligences numériques, 9782840163886
Evaluating Hierarchical Clustering Methods for Corpora with Chronological Order. EADH2021: Interdisciplinary Perspectives on Data. Second International Conference of the European Association for Digital Humanities, EADH, Sep 2021, Krasnoyarsk, Russia
Extracting Event-related Information from a Corpus Regarding Soil Industrial Pollution. KDIR 2021, Oct 2021, Setúbal, Portugal. pp.217-224
⟨10.5220/0010656700003064⟩
The Corpus for Idiolectal Research (CIDRE). European Association of Digital Humanities Conference (EADH 2021), Sep 2021, Krasnoyarsk, Russia
Variation graphique dans les documents d'Ancien Régime : Nouvelles approches scriptométriques. Journée d’étude : « Pour une histoire de la langue ‘par en bas’: textes privés et variation des langues dans le passé », Sep 2021, Paris, France
Normalisation of 16th and 17th century texts in French and geographical named entity recognition. ACM SIGSPATIAL GeoHumanities'20, ACM, Nov 2020, Seattle (virtual), United States. pp.28-34
⟨10.1145/3423337.3429437⟩
Phylogenetic networks: how advanced are the methods?. Networks and Evolution Conference, Sep 2020, Paris, France
Counting phylogenetic networks of level 1 and 2. Journal of Mathematical Biology, 2020, 81, pp.1357-1395
⟨10.1007/s00285-020-01543-5⟩
Ce que les données textuelles disent du pétitionnement en ligne : entre contraintes et appropriations du dispositif. Colloque 'Internet et les nouvelles formes de participation politique', Mar 2019, Lille, France
⟨10.4000/questionsdecommunication.21042⟩
Marceline Desbordes-Valmore sur Wikisource : plus accessible, donc plus enseignée ?. J'écris pourtant, 2019, 3, pp.153-156
Ce que les données textuelles disent du pétitionnement en ligne. Questions de communication, 2019, 36 (2019/2), pp.123-146
⟨10.4000/questionsdecommunication.21042⟩
Cutting an alignment with Ockham's razor. 2019
Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang. Solving the tree containment problem in linear time for nearly stable phylogenetic networks. Discrete Applied Mathematics, 2018, 246, pp.62-79
⟨10.1016/j.dam.2017.07.015⟩
Appeler à signer une pétition en ligne : caractéristiques linguistiques des appels. JADT 2018, Jun 2018, Rome, Italie. pp.68-75
Anatomie, animaux, vocabulaire de la vivisection. Gisèle Séginger. Animalhumanité - Expérimentation et fiction : l’animalité au cœur du vivant, LISAA, pp.223-231, 2018, Savoirs en Texte, 978-2-9566480-1-7
Uprooted Phylogenetic Networks. Bulletin of Mathematical Biology, 2017, 79 (9), pp.2022-2048
⟨10.1007/s11538-017-0318-x⟩
Rearrangement Moves on Rooted Phylogenetic Networks. PLoS Computational Biology, 2017, 13 (8), pp.e1005611
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Development of an in silico method for the identification of subcomplexes involved in the biogenesis of multiprotein complexes in Saccharomyces cerevisiae. BMC Systems Biology, 2017, 11 (67), pp.1-12
⟨10.1186/s12918-017-0442-0⟩
Corpus Biolographes version 1.0 : construire, analyser, cartographier. Colloque final du programme ANR/DFG Biolographes - Création littéraire et savoirs du vivant au XIXe siècle, Jan 2017, Paris, France
On the challenge of reconstructing level-1 phylogenetic networks from triplets and clusters. Journal of Mathematical Biology, 2017, 74 (7), pp.1729-1751
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Who is Who in Phylogenetic Networks: Articles, Authors and Programs. 2016
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Analyser des pétitions en ligne : potentialités et limites d'un dispositif d'étude pluridisciplinaire. JADT 2016, Jun 2016, Nice, France. pp.772-781
Do branch lengths help to locate a tree in a phylogenetic network?. Bulletin of Mathematical Biology, 2016, 78 (9), pp.1773-1795
⟨10.1007/s11538-016-0199-4⟩
Trouver un arbre de gène dans le réseau des espèces : le labyrinthe du vivant !. Fête de la Science 2016 - UPEM, Oct 2016, Champs-sur-Marne, France
Une approche textométrique pour étudier la transmission des savoirs biologiques au XIXe siècle. Nouvelles perspectives en sciences sociales, 2016, 12 (1), pp.221-253
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Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang. Locating a Tree in a Phylogenetic Network in Quadratic Time. RECOMB 2015, Apr 2015, Varsovie, Poland. pp.96-107
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Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang. Solving the Tree Containment Problem for Genetically Stable Networks in Quadratic Time. IWOCA 2015, Oct 2015, Verona, Italy. pp.197-208
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(Nearly-)tight bounds on the contiguity and linearity of cographs. Theoretical Computer Science, 2014, 522, pp.1-12
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Barbier, Philippe P. Breucker, Hilde Eggermont, Philippe Gambette, et al.. Vers une approche semi-automatique pour la définition de motifs d'argumentation utilisés dans les résumés de projets scientifiques du domaine de la biodiversité. Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2014, Fouille de Données et Humanités Numériques, RNTI-SHS-2 (2), pp.47-80
Élaboration d'un outil d'évaluation des performances en dénomination pour les patients bilingues atteints de la maladie d'Alzheimer. Rééducation orthophonique, 2013, 253, pp.143-152
L'affaire du Mediator au prisme de la textométrie. Texto ! Textes et Cultures, 2013, XVIII (4), pp.3318.1-3318.9
Linear-time Constant-ratio Approximation Algorithm and Tight Bounds for the Contiguity of Cographs. Seventh International Workshop on Algorithms and Computation, Feb 2013, Kharagpur, India. pp.126-136
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Chapple, Benoît Robisson, Anaïs Baudot, et al.. Clust&See: A Cytoscape plugin for the identification, visualization and manipulation of network clusters. BioSystems, 2013, 113 (2), pp.91-93
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On Encodings of Phylogenetic Networks of Bounded Level. Journal of Mathematical Biology, 2012, 65 (1), pp.157-180
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Estimation de la neutralité culturelle d'un ensemble d'images destinées à l'évaluation des performances en dénomination. Fédération nationale des Orthophonistes. Colloque international "Perspectives neuropsycholinguistiques sur l'aphasie", Jun 2012, Toulouse, France. L'aphasie chez le bilingue, pp.1-6, 2013
Longueur de branches et arbres de mots. Corpus, 2012, 11 (-), pp.129-146
Bootstrap clustering for graph partitioning. RAIRO - Operations Research, 2011, 45 (4), pp.339-352
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ModClust: a Cytoscape plugin for modularity-based clustering of networks. MARAMI 2011, Oct 2011, Grenoble, France
Reconstruction combinatoire de réseaux phylogénétiques. Biosystema, 2011, 28, pp.85-92
Utilisation de l'analyse textuelle automatique dans la recherche sur la maladie d'Alzheimer. Colloque international des jeunes chercheurs en Didactique des Langues et en Linguistique, Jun 2010, Grenoble, France
Utilisation de la visualisation en nuage arboré pour l'analyse littéraire. JADT'10: 10th International Conference on statistical analysis of textual data, Jun 2010, Rome, Italie. pp.12
Méthodes combinatoires de reconstruction de réseaux phylogénétiques. Informatique [cs]. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2010. Français
Unrestricted and complete Breadth-First Search of trapezoid graphs in O(n) time. Information Processing Letters, 2010, 110, pp.497-502
⟨10.1016/j.ipl.2010.03.015⟩
Densidées : calcul automatique de la densité des idées dans un corpus oral. RECITAL'2010 : 12ième Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues, Jul 2010, Montréal, Canada. pp.1-10
Computing Galled Networks from Real Data. Bioinformatics, 2009, 25 (12), pp.i85-i93
⟨10.1093/bioinformatics/btp217⟩
Efficient Neighbourhood Encoding for Interval Graphs and Permutation Graphs and O(n) Breadth-First Search. IWOCA'09: 20th International Workshop on Combinatorial Algorithms, Jun 2009, Hradec nad Moravicí, Czech Republic. pp.146-157
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Visualising a Text with a Tree Cloud. IFCS'09: International Federation of Classification Societies Conference, Mar 2009, Dresde, Germany. pp.561-569
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The Structure of Level-k Phylogenetic Networks. CPM: Combinatorial Pattern Matching, Jun 2009, Lille, France. pp.289-300
⟨10.1007/978-3-642-02441-2_26⟩
Improved Layout of Phylogenetic Networks. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2008, 5 (3), pp.472-479
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On restrictions of balanced 2-interval graphs. 33rd International Workshop on Graph-Theoretic Concepts in Computer Science (WG'07), ?, Jun 2007, Dornburg, Germany. pp.55-65
⟨10.1007/978-3-540-74839-7_6⟩