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Philippe GAMBETTE

Maître de conférences en informatique

Champs-sur-Marne

Bâtiment: Building: Copernic

5 boulevard Descartes$Champs-sur-Marne$77454 Marne-la-Vallée Cedex 2

Bureau: Office: 4B100

+33 (0)1 60 95 77 34

Philippe GAMBETTE

Maître de conférences en informatique

Maitre de conférences en informatique, j'effectue mes recherches en algorithmique pour les humanités numériques et pour la bioinformatique au LIGM, Laboratoire d'informatique Gaspard-Monge. Je m'intéresse en particulier à des problématiques d'analyses de réseaux en développant des algorithmes de graphes, et à des questions algorithmiques ou mathématiques d'alignement entre structures (textes, arbres, réseaux, etc.).

Je donne la plupart de mes enseignements au département MMI, Métiers du multimédia et de l'internet, à l'IUT de Marne-la-Vallée, sur le site de Champs-sur-Marne. J'y enseigne le développement web en Javascript et les bases de données. J'enseigne aussi le Javascript en master Culture et métiers du web et l'intégration HTML/CSS en master Édition du livre papier et numérique.

Je co-encadre avec Catherine Dominguès le doctorat de Chuanming Dong (ADEME, IGN) au LASTIG depuis octobre 2019. Je co-encadre avec Cyril Nicaud le doctorat d'Aaron Boussidan (Université Gustave Eiffel) au LIGM depuis septembre 2021.

Membre depuis février 2017 du conseil de la formation doctorale de la COMUE Paris-Est Sup, je suis aussi référent Égalité de Paris-Est Sup avec Bénédicte François. Chargé de mission « Science ouverte » pour la vice-présidence recherche de l'université Gustave Eiffel depuis mars 2021, je coordonne le réseau des ambassadeurs et ambassadrices DATA de l'atelier Data Univ. Eiffel.

Mes dernières références

My latest references

Publications

Frédérique Bordignon, Philippe Gambette
A Corpus of Critical Citations Contexts. Journal of Open Humanities Data, 2024, 10, pp.1-6
10.5334/johd.215
Philippe Gambette
Le don par Marceline Desbordes-Valmore du portrait de son père au musée de la Chartreuse. J'écris pourtant, 2024, 5, pp.181-189
Pierre Bourhis, Aaron Boussidan, Céline Fournial, Philippe Gambette
Detecting semantic or structural similarities for theater play comparison. JADT 2024, Jun 2024, Bruxelles (BE), Belgium. pp.139-148
Philippe Gambette
Les lieux nommés d’après Marceline Desbordes-Valmore. J'écris pourtant, 2024, 5, pp.87-98
Sarah J
Berkemer, Pierre Bourhis, Philippe Gambette, Lionel Seinturier, Marion Tommasi. A Database Approach to Solve the Tree Containment Problem in Phylogenetic Networks. Mathematics of Evolution - Phylogenetic Trees and Networks. Workshop 1: Foundations of Phylogenetic Networks, Sep 2023, Singapour, Singapore. pp.5-8
Pierre Bourhis, Aaron Boussidan, Philippe Gambette
On Distances between Words with Parameters. CPM 2023, Jun 2023, Champs-sur-Marne, Marne-la-Vallée, France. pp.6:1-6:23
10.4230/LIPIcs.CPM.2023.6
Simon Gabay, Philippe Gambette, Rachel Bawden, Benoît Sagot
Ancien ou moderne ? Pistes computationnelles pour l'analyse graphématique des textes écrits au XVIIe siècle. Linx, 2023, 85
10.4000/linx.9346
Chuanming Dong, Philippe Gambette, Catherine Dominguès
Extraction et caractérisation de noyaux d’événements liés à la pollution industrielle. JADT 2022, Jul 2022, Naples, Italie. pp.354-360
Rachel Bawden, Jonathan Poinhos, Eleni Kogkitsidou, Philippe Gambette, Benoît Sagot, et al.
Automatic Normalisation of Early Modern French. LREC 2022 - 13th Language Resources and Evaluation Conference, European Language Resources Association, Jun 2022, Marseille, France. pp.3354-3366
Olga Seminck, Philippe Gambette, Dominique Legallois, Thierry Poibeau
The Evolution of the Idiolect over the Lifetime: A Quantitative and Qualitative Study of French 19th Century Literature. Soirée networking PRAIRIE, Sep 2022, Paris, France. 2022
Olga Seminck, Philippe Gambette, Dominique Legallois, Thierry Poibeau
The Evolution of the Idiolect over the Lifetime: A Quantitative and Qualitative Study of French 19th Century Literature. Journal of Cultural Analytics, 2022, 7 (3)
10.22148/001c.37588
Nicole Dufournaud, Philippe Gambette, Toshinori Uetani, Anne-Laure Allain
Édition numérique et valorisation du livre de compte de la reine Marguerite de Navarre rédigé par son secrétaire Jehan Frotté. Assemblée générale 2022 du programme de recherche « Bibliothèques Virtuelles Humanistes », Programme de recherche « Bibliothèques Virtuelles Humanistes », Nov 2022, Tours, France
Laurent Bulteau, Philippe Gambette, Olga Seminck
Reordering a tree according to an order on its leaves. CPM 2022, Jun 2022, Prague, Czech Republic. pp.24:1-24:15
10.4230/LIPIcs.CPM.2022.24
Simon Gabay, Rachel Bawden, Benoît Sagot, Philippe Gambette
Vers l’étude linguistique sur données artificielles. Variation(s) en français, ATILF, Nov 2022, Nancy, France
Simon Gabay, Rachel Bawden, Philippe Gambette, Jonathan Poinhos, Eleni Kogkitsidou, et al.
Le changement linguistique au XVIIe s. : nouvelles approches scriptométriques. CMLF 2022 - 8e Congrès Mondial de Linguistique Française, Jul 2022, Orléans, France. pp.02006.1-14
10.1051/shsconf/202213802006
Simon Gabay, Pedro Ortiz Suarez, Rachel Bawden, Alexandre Bartz, Philippe Gambette, et al.
Le projet FREEM : ressources, outils et enjeux pour l’étude du français d’Ancien Régime. TALN 2022 - Traitement Automatique des Langues Naturelles, Jun 2022, Avignon, France. pp.154-165
Simon Gabay, Pedro Ortiz Suarez, Alexandre Bartz, Alix Chagué, Rachel Bawden, et al.
From FreEM to D'AlemBERT. 13th Language Resources and Evaluation Conference - LREC 2022, European Language Resources Association, Jun 2022, Marseille, France. pp.3367-3374
Nicole Dufournaud, Philippe Gambette, Caroline Trotot
Identifier, représenter, penser les réseaux urbains de l’humanisme autour de Marguerite de Valois : l’exemple du voyage des Flandres (1577). Les femmes dans les réseaux urbains de l’humanisme (1492-1615), Jun 2022, Bordeaux, France
Alexandre Bartz, Juliette Janes, Laurent Romary, Philippe Gambette, Rachel Bawden, et al.
Expanding the content model of annotationBlock. Next Gen TEI, 2021 - TEI Conference and Members’ Meeting, Oct 2021, Virtual, United States
Olga Seminck, Philippe Gambette, Dominique Legallois, Thierry Poibeau
The Corpus for Idiolectal Research (CIDRE). Journal of Open Humanities Data, 2021, 7, pp.15
10.5334/johd.42
Philippe Gambette, Nadège Lechevrel, Caroline Trotot
Valoriser des corpus littéraires numériques avec Wikisource : de la recherche à la pédagogie. Lionel Barbe; Marta Severo. Wikipédia. Objet de médiation et de transmission des savoirs, Presses universitaires de Paris Nanterre, pp.159-176, 2021, Intelligences numériques, 9782840163886
Philippe Gambette, Olga Seminck, Dominique Legallois, Thierry Poibeau
Evaluating Hierarchical Clustering Methods for Corpora with Chronological Order. EADH2021: Interdisciplinary Perspectives on Data. Second International Conference of the European Association for Digital Humanities, EADH, Sep 2021, Krasnoyarsk, Russia
Chuanming Dong, Philippe Gambette, Catherine Dominguès
Extracting Event-related Information from a Corpus Regarding Soil Industrial Pollution. KDIR 2021, Oct 2021, Setúbal, Portugal. pp.217-224
10.5220/0010656700003064
Olga Seminck, Philippe Gambette, Dominique Legallois, Thierry Poibeau
The Corpus for Idiolectal Research (CIDRE). European Association of Digital Humanities Conference (EADH 2021), Sep 2021, Krasnoyarsk, Russia
Simon Gabay, Philippe Gambette, Rachel Bawden, Jonathan Poinhos, Eleni Kogkitsidou, et al.
Variation graphique dans les documents d'Ancien Régime : Nouvelles approches scriptométriques. Journée d’étude : « Pour une histoire de la langue ‘par en bas’: textes privés et variation des langues dans le passé », Sep 2021, Paris, France
Eleni Kogkitsidou, Philippe Gambette
Normalisation of 16th and 17th century texts in French and geographical named entity recognition. ACM SIGSPATIAL GeoHumanities'20, ACM, Nov 2020, Seattle (virtual), United States. pp.28-34
10.1145/3423337.3429437
Philippe Gambette
Phylogenetic networks: how advanced are the methods?. Networks and Evolution Conference, Sep 2020, Paris, France
Mathilde Bouvel, Philippe Gambette, Marefatollah Mansouri
Counting phylogenetic networks of level 1 and 2. Journal of Mathematical Biology, 2020, 81, pp.1357-1395
10.1007/s00285-020-01543-5
Christine Barats, Anne Dister, Philippe Gambette, Jean-Marc Leblanc, Marie Peres-Leblanc
Ce que les données textuelles disent du pétitionnement en ligne : entre contraintes et appropriations du dispositif. Colloque 'Internet et les nouvelles formes de participation politique', Mar 2019, Lille, France
10.4000/questionsdecommunication.21042
Philippe Gambette
Marceline Desbordes-Valmore sur Wikisource : plus accessible, donc plus enseignée ?. J'écris pourtant, 2019, 3, pp.153-156
Christine Barats, Anne Dister, Philippe Gambette, Jean-Marc Leblanc, Marie Peres-Leblanc
Ce que les données textuelles disent du pétitionnement en ligne. Questions de communication, 2019, 36 (2019/2), pp.123-146
10.4000/questionsdecommunication.21042
Mark Jones, Philippe Gambette, Leo van Iersel, Remie Janssen, Steven Kelk, et al.
Cutting an alignment with Ockham's razor. 2019
Philippe Gambette, Andreas D.M
Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang. Solving the tree containment problem in linear time for nearly stable phylogenetic networks. Discrete Applied Mathematics, 2018, 246, pp.62-79
10.1016/j.dam.2017.07.015
Christine Barats, Anne Dister, Philippe Gambette, Jean-Marc Leblanc, Marie Pérès
Appeler à signer une pétition en ligne : caractéristiques linguistiques des appels. JADT 2018, Jun 2018, Rome, Italie. pp.68-75
Philippe Gambette, Tita Kyriacopoulou, Nadège Lechevrel, Claude Martineau
Anatomie, animaux, vocabulaire de la vivisection. Gisèle Séginger. Animalhumanité - Expérimentation et fiction : l’animalité au cœur du vivant, LISAA, pp.223-231, 2018, Savoirs en Texte, 978-2-9566480-1-7
Philippe Gambette, Katharina Huber, Guillaume Scholz
Uprooted Phylogenetic Networks. Bulletin of Mathematical Biology, 2017, 79 (9), pp.2022-2048
10.1007/s11538-017-0318-x
Philippe Gambette, Leo van Iersel, Mark Jones, Manuel Lafond, Fabio Pardi, et al.
Rearrangement Moves on Rooted Phylogenetic Networks. PLoS Computational Biology, 2017, 13 (8), pp.e1005611
10.1371/journal.pcbi.1005611
Annie Glatigny, Philippe Gambette, Alexa Bourand-Plantefol, Geneviève Dujardin, Marie-Hélène Mucchielli-Giorgi
Development of an in silico method for the identification of subcomplexes involved in the biogenesis of multiprotein complexes in Saccharomyces cerevisiae. BMC Systems Biology, 2017, 11 (67), pp.1-12
10.1186/s12918-017-0442-0
Nadège Lechevrel, Philippe Gambette
Corpus Biolographes version 1.0 : construire, analyser, cartographier. Colloque final du programme ANR/DFG Biolographes - Création littéraire et savoirs du vivant au XIXe siècle, Jan 2017, Paris, France
Philippe Gambette, Katharina Huber, Steven Kelk
On the challenge of reconstructing level-1 phylogenetic networks from triplets and clusters. Journal of Mathematical Biology, 2017, 74 (7), pp.1729-1751
10.1007/s00285-016-1068-3
Tushar Agarwal, Philippe Gambette, David Morrison
Who is Who in Phylogenetic Networks: Articles, Authors and Programs. 2016
10.48550/arXiv.1610.01674 Focus to learn more
Christine Barats, Anne Dister, Philippe Gambette, Jean-Marc Leblanc, Marie Pérès
Analyser des pétitions en ligne : potentialités et limites d'un dispositif d'étude pluridisciplinaire. JADT 2016, Jun 2016, Nice, France. pp.772-781
Philippe Gambette, Leo van Iersel, Steven Kelk, Fabio Pardi, Celine Scornavacca
Do branch lengths help to locate a tree in a phylogenetic network?. Bulletin of Mathematical Biology, 2016, 78 (9), pp.1773-1795
10.1007/s11538-016-0199-4
Philippe Gambette
Trouver un arbre de gène dans le réseau des espèces : le labyrinthe du vivant !. Fête de la Science 2016 - UPEM, Oct 2016, Champs-sur-Marne, France
Nadège Lechevrel, Philippe Gambette
Une approche textométrique pour étudier la transmission des savoirs biologiques au XIXe siècle. Nouvelles perspectives en sciences sociales, 2016, 12 (1), pp.221-253
10.7202/1038375ar
Philippe Gambette, Andreas D.M
Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang. Locating a Tree in a Phylogenetic Network in Quadratic Time. RECOMB 2015, Apr 2015, Varsovie, Poland. pp.96-107
10.1007/978-3-319-16706-0_12
Philippe Gambette, Andreas D.M
Gunawan, Anthony Labarre, Stéphane Vialette, Louxin Zhang. Solving the Tree Containment Problem for Genetically Stable Networks in Quadratic Time. IWOCA 2015, Oct 2015, Verona, Italy. pp.197-208
10.1007/978-3-319-29516-9_17
Christophe Crespelle, Philippe Gambette
(Nearly-)tight bounds on the contiguity and linearity of cographs. Theoretical Computer Science, 2014, 522, pp.1-12
10.1016/j.tcs.2013.11.036
Hyeran Lee, Philippe Gambette, Melissa Barkat-Defradas
iPhocomp : calcul automatique de l’indice de complexité phonétique de Jakielski. JEP 2014, XXXè édition des Journées d'Etudes sur la Parole, Jun 2014, Le Mans, France. pp.622-630, 2014, Actes de la XXXe édition des Journées d'Etudes sur la Parole
Rosa Cetro, Marc M
Barbier, Philippe P. Breucker, Hilde Eggermont, Philippe Gambette, et al.. Vers une approche semi-automatique pour la définition de motifs d'argumentation utilisés dans les résumés de projets scientifiques du domaine de la biodiversité. Revue des Nouvelles Technologies de l'Information, 2014, Fouille de Données et Humanités Numériques, RNTI-SHS-2 (2), pp.47-80
Hyeran Lee, Philippe Gambette, Frederique Gayraud, Melissa Barkat-Defradas
Élaboration d'un outil d'évaluation des performances en dénomination pour les patients bilingues atteints de la maladie d'Alzheimer. Rééducation orthophonique, 2013, 253, pp.143-152
Philippe Gambette, William Martinez
L'affaire du Mediator au prisme de la textométrie. Texto ! Textes et Cultures, 2013, XVIII (4), pp.3318.1-3318.9
Christophe Crespelle, Philippe Gambette
Linear-time Constant-ratio Approximation Algorithm and Tight Bounds for the Contiguity of Cographs. Seventh International Workshop on Algorithms and Computation, Feb 2013, Kharagpur, India. pp.126-136
10.1007/978-3-642-36065-7_13
Lionel Spinelli, Philippe Gambette, Charles E
Chapple, Benoît Robisson, Anaïs Baudot, et al.. Clust&See: A Cytoscape plugin for the identification, visualization and manipulation of network clusters. BioSystems, 2013, 113 (2), pp.91-93
10.1016/j.biosystems.2013.05.010
Philippe Gambette, Vincent Berry, Christophe Paul
Quartets and Unrooted Phylogenetic Networks. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2012, 10 (4), pp.1250004.1-1250004.23
10.1142/S0219720012500047
Christophe Crespelle, Philippe Gambette
(Nearly-)Tight Bounds on the Linearity and Contiguity of Cographs. Bordeaux Graph Workshop, Nov 2012, France. pp.2
Philippe Gambette, Katharina Huber
On Encodings of Phylogenetic Networks of Bounded Level. Journal of Mathematical Biology, 2012, 65 (1), pp.157-180
10.1007/s00285-011-0456-y
Melissa Barkat-Defradas, Frederique Gayraud, Hyeran Lee, Philippe Gambette
Estimation de la neutralité culturelle d'un ensemble d'images destinées à l'évaluation des performances en dénomination. Fédération nationale des Orthophonistes. Colloque international "Perspectives neuropsycholinguistiques sur l'aphasie", Jun 2012, Toulouse, France. L'aphasie chez le bilingue, pp.1-6, 2013
Philippe Gambette, Núria Gala, Alexis Nasr
Longueur de branches et arbres de mots. Corpus, 2012, 11 (-), pp.129-146
Philippe Gambette, Alain Guénoche
Bootstrap clustering for graph partitioning. RAIRO - Operations Research, 2011, 45 (4), pp.339-352
10.1051/ro/2012001
Laurent Tichit, Philippe Gambette, Alain Guénoche
ModClust: a Cytoscape plugin for modularity-based clustering of networks. MARAMI 2011, Oct 2011, Grenoble, France
Philippe Gambette
Reconstruction combinatoire de réseaux phylogénétiques. Biosystema, 2011, 28, pp.85-92
Hyeran Lee, Philippe Gambette, Melissa Barkat-Defradas
Utilisation de l'analyse textuelle automatique dans la recherche sur la maladie d'Alzheimer. Colloque international des jeunes chercheurs en Didactique des Langues et en Linguistique, Jun 2010, Grenoble, France
Delphine Amstutz, Philippe Gambette
Utilisation de la visualisation en nuage arboré pour l'analyse littéraire. JADT'10: 10th International Conference on statistical analysis of textual data, Jun 2010, Rome, Italie. pp.12
Philippe Gambette
Méthodes combinatoires de reconstruction de réseaux phylogénétiques. Informatique [cs]. Université Montpellier II - Sciences et Techniques du Languedoc, 2010. Français
Christophe Crespelle, Philippe Gambette
Unrestricted and complete Breadth-First Search of trapezoid graphs in O(n) time. Information Processing Letters, 2010, 110, pp.497-502
10.1016/j.ipl.2010.03.015
Hyeran Lee, Philippe Gambette, Elsa Maillé, Constance Thuillier
Densidées : calcul automatique de la densité des idées dans un corpus oral. RECITAL'2010 : 12ième Rencontre des Étudiants Chercheurs en Informatique pour le Traitement Automatique des Langues, Jul 2010, Montréal, Canada. pp.1-10
Daniel Huson, Regula Rupp, Vincent Berry, Philippe Gambette, Christophe Paul
Computing Galled Networks from Real Data. Bioinformatics, 2009, 25 (12), pp.i85-i93
10.1093/bioinformatics/btp217
Christophe Crespelle, Philippe Gambette
Efficient Neighbourhood Encoding for Interval Graphs and Permutation Graphs and O(n) Breadth-First Search. IWOCA'09: 20th International Workshop on Combinatorial Algorithms, Jun 2009, Hradec nad Moravicí, Czech Republic. pp.146-157
10.1007/978-3-642-10217-2_17
Philippe Gambette, Jean Véronis
Visualising a Text with a Tree Cloud. IFCS'09: International Federation of Classification Societies Conference, Mar 2009, Dresde, Germany. pp.561-569
10.1007/978-3-642-10745-0_61
Philippe Gambette, Vincent Berry, Christophe Paul
The Structure of Level-k Phylogenetic Networks. CPM: Combinatorial Pattern Matching, Jun 2009, Lille, France. pp.289-300
10.1007/978-3-642-02441-2_26
Philippe Gambette, Daniel Huson
Improved Layout of Phylogenetic Networks. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2008, 5 (3), pp.472-479
10.1109/tcbb.2007.1046
Philippe Gambette, Stéphane Vialette
On restrictions of balanced 2-interval graphs. 33rd International Workshop on Graph-Theoretic Concepts in Computer Science (WG'07), ?, Jun 2007, Dornburg, Germany. pp.55-65
10.1007/978-3-540-74839-7_6

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