Doctorante en chimie théorique sous la direction de Pr. Isabelle Navizet, je travaille sur la modélisation et la simulation de protéines fluorescentes. Mes recherches reposent principalement sur la dynamique moléculaire de systèmes biologiques et des approches hybrides multi-échelles (tout-atome/gros-grains et quantique–classique) afin de concevoir de nouvelles structures absorbant dans le proche infrarouge.

J’ai été amenée à développer un champ de force hybride, combinant une description tout atome et gros grains pour les protéines, dans l’objectif de réaliser des simulations sur de longues échelles de temps. Cette approche m’a permis d’étudier les changements conformationnels de la biliverdine au sein de la protéine, notamment à travers des simulations d’Umbrella Sampling et d’Adaptive Steered Molecular Dynamics, menées à différentes échelles de description (atomistique et hybride). L’analyse de ces simulations a conduit à l’identification d’interactions stabilisantes clés, ouvrant la voie à la conception de mutations ciblées de la protéine. Dans un second temps, ces résultats ont servi de base à la réalisation de simulations de spectres d’absorption par des approches QM/MM.

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